stripeからStripe の禁止業種のリストに示されているとおり、弊社では、タバコ類の商品に該当する決済をサポートすることはできません。と連絡がありましたが、その他の決済手段は利用可能なのでしょうか？

Stripeの禁止業種に該当する商材は、他の決済手段だけで販売することもできません。Lineupを利用するには、必ずStripeのクレジットカード決済加盟店になる必要があるためです。

そのため、Stripe側で取り扱い不可と判断される商材は、Lineup上での販売対象にできない形になります。迷いやすい設定は、事前にテスト注文や管理画面の確認をしておくと運用開始後の混乱を防ぎやすくなります。

運用ルールや表示内容に関わる項目は、公開前に自分のショップ設定でも一度確認しておくと安心です。